Đối tượng của dự án AquaViet là đề ra phương án và thực hiện việc cung cấp nước sạch qua công nghệ khai thác  nước thấm lọc từ sông tại Việt Nam. Đặc biệt dự án sẽ đánh giá những lợi thế và giới hạn việc ứng dụng công nghệ này trong điều kiện khó khăn của khu vực ven sông, nơi bị ảnh hưởng mạnh bởi độ đục, chất hữu cơ, chất ô nhiễm, amoni, asen, sắt, mangan, vi sinh vật gây bệnh và nguy cơ lũ lụt  tại hai địa điểm trên sông Cầu và sông Hồng và đề ra giải pháp cho việc lắp đặt và vận hành các thiết bị sản xuất và xử lý nước. Dựa trên những dự đoán cũng như những bằng chứng thu được trong quá trình thực hiện dự án về sự thay đổi chất lượng của nước khai thác qua cách thức thấm lọc nước sông và  nước ngầm , dự án sẽ điều chỉnh và phát triển các công nghệ tiên tiến để xử lý nguồn nước thô một cách hiệu quả và tiết kiệm chi phí, cũng như  xây dựng các hệ thống giám sát phù hợp.